Audito tikslui, vizijai, lūkesčiams ir ištekliams aptarti iki audito inicijavimo audito departamento vadovas organizuoja susitikimą su vadovybe. Susitikime strateginį tyrimą atlikusio departamento darbuotojas pristato audito temą ir tikslą. Taip pat sutariama, ar valstybės kontrolierius ir (ar) valstybės kontrolieriaus pavaduotojas, kuriam tiesiogiai pavaldus auditą atliekantis departamentas, planuoja dalyvauti susitikime su audituojamu subjektu pradedant auditą.
Inicijuojant auditą reikia įsitikinti, kad audito grupė turi reikiamų kompetencijų, įskaitant projekto valdymo žinių, kaip to reikalauja 3000-ojo TAAIS 96–97 p., o auditui numatyti ištekliai yra pakankami.
ViPSIS turi būti nurodyti (jeigu iki tol nebuvo nurodyti) su valstybės kontrolieriaus pavaduotoju, kuriam tiesiogiai pavaldus auditą atliekantis departamentas, suderinti audito objektas, tikslas, pagrindinis (-iai) audituojamas subjektas (-ai). Audito tikslas turi būti aiškiai apibrėžtas ir susijęs su ekonomiškumo, efektyvumo ir (ar) rezultatyvumo principais, kaip numatyta 3000-ojo TAAIS 35–36 p. Išsamiau apie audito objekto, tikslo nustatymą ir audituojamo (-ų) subjekto (-ų) pasirinkimą Audito plano rengimo skiltyje.
Auditas, o kartu ir išankstinis tyrimas pradedamas ViPSIS patvirtinus jo pradžią. Detalesnė informacija, kaip inicijuoti ir dokumentuoti auditą ViPSIS, pateikiama ViPSIS naudotojo vadovuose.
Išskirtinėmis aplinkybėmis auditas gali būti pradėtas be strateginio tyrimo (pvz., įtraukus į Valstybės kontrolės metinį veiklos planą Seimo nutarimu pavestą atlikti auditą) ir (ar) be išankstinio tyrimo, ir (ar) atliekant ne visos apimties išankstinį tyrimą (pvz., strateginio tyrimo metu identifikuotos faktais ir (ar) pavyzdžiais pagrįstos problemos (rizikos) ir nereikia rinkti papildomos informacijos ir kt.). Sprendimas neatlikti išankstinio tyrimo ar tam tikrų jo etapų turi būti suderintas su valstybės kontrolieriaus pavaduotoju, kuriam tiesiogiai pavaldus auditą atliekantis departamentas.